Truyện tranh "Trở Thành Bạn Tình Của Đồng Nghiệp Khó Chịu" xoay quanh cuộc sống của hai nhân vật chính là Rin, một nhân viên văn phòng năng động và lúc nào cũng lấy trước gương mặt lạnh lùng, cùng với Yu, đồng nghiệp khó chịu với vẻ ngoài luôn tự cao tự đại.
Mở đầu câu chuyện, trong một ngày làm việc tẻ nhạt và căng thẳng, Rin tình cờ phát hiện ra bí mật đen tối của Yu - anh chàng lạnh lùng này thực chất là một người có trái tim ấm áp, luôn tận tụy giúp đỡ đồng nghiệp mỗi khi họ gặp khó khăn. Sự khám phá này không chỉ khiến Rin ngạc nhiên mà còn mở ra cơ hội để họ hiểu rõ hơn về nhau.
Dần dần, mối quan hệ giữa Rin và Yu không còn là sự cạnh tranh và khó chịu mà thay vào đó là sự hiểu biết, cảm thông và quý trọng. Cả hai bắt đầu dành nhiều thời gian bên nhau hơn, chia sẻ niềm vui lẫn nỗi buồn của cuộc sống. Mối quan hệ ban đầu chỉ là đồng nghiệp dần biến thành tình bạn sâu đậm, và cuối cùng là tình yêu.
Cuộc sống mới của Rin và Yu đầy màu sắc hơn bao giờ hết, khiến cho họ nhận ra rằng, đôi khi người bạn tưởng chừng khó chịu nhất lại chính là người đồng hành đáng trân trọng nhất trong cuộc đời. Với sự thấu hiểu và cảm thông, họ cùng nhau vượt qua mọi khó khăn, tìm ra niềm hạnh phúc trong sự gần gũi và chân thành của tình yêu đích thực.
